Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd1P40201 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms