Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TtlP38585 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TtlP38585 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtlP38585 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TtlP38585 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms