Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lig1P37913 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms