Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn1P35821 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms