Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms