Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms