Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms