Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtmaP26350 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms