Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmbsP22907 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmbsP22907 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmbsP22907 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmbsP22907 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms