Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms