Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb2P21619 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms