Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms