Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VimP20152 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VimP20152 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VimP20152 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VimP20152 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VimP20152 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VimP20152 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VimP20152 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VimP20152 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms