Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms