Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms