Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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PtpraP18052 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms