Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata1P17679 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata1P17679 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms