Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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