Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcna1P16388 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms