Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gabra6P16305 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gabra6P16305 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gabra6P16305 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gabra6P16305 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabra6P16305 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gabra6P16305 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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