Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms