Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms