Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt8P11679 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms