Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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