Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SparcP07214 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SparcP07214 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SparcP07214 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SparcP07214 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SparcP07214 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SparcP07214 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SparcP07214 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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