Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcb1bP06795 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcb1bP06795 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms