Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc1P02468 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms