Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01650 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01650 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01650 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01650 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01650 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01650 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01650 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01650 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms