Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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