Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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