Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srpk1O70551 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms