Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SgceO70258 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SgceO70258 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SgceO70258 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgceO70258 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgceO70258 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgceO70258 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgceO70258 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgceO70258 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgceO70258 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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