Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr1O55100 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr1O55100 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms