Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffbO54788 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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