Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms