Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd9O35177 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms