Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncoa3O09000 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncoa3O09000 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms