Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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