Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20834J3QM72 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms