Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29394H3BIW7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms