Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms