Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms