Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms