Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms