Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3371F7CQW8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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