Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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