Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Gm21977F6U3N7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21977F6U3N7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21977F6U3N7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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