Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aldh3b2E9Q3E1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms