Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tarbp1E9Q368 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms