Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp558E9Q1J0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp558E9Q1J0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp558E9Q1J0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp558E9Q1J0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp558E9Q1J0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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